三種均屬不同的知識產權類型，不存在何謂優勢何謂不足，差別在于各自保護范圍和對象存在不同。某些情況下，商標權和版權的保護范圍可能會重合，需要根據具體情況選擇以何種權利作為訴訟權利進行主張。不過，對于一款APP產品來說，三者結合是最好的保護策略。

商標：（1）文字：可保護APP的名稱、簡稱或者異稱；（2）圖形：可保護APP本身的圖標、APP內常出現的圖形。

版權：（1）APP程序本身；（2）APP內的自行設計的圖像、人物肖像、場景、文字說明、臺詞等等。

專利：純軟件是無法取得專利保護的（即使是在陽光下一切皆可專利化的美國，也不是那么容易獲得軟件專利的，現今更難）；在我國如要取得與軟件相關的專利，必須和硬件設備結合，方能以方法專利提交申請。

商標保護的是文字或圖形的專用權，該專用權僅限于核定使用的類別。什么意思呢？比如你有一個提供教育培訓支持的APP，屬于第41類，那么你可以禁止他人在第41類使用與你的APP文字或圖形相同或近似的標識，但是在其他類別（比如第25類服裝）就鞭長莫及了。當然，也存在例外受保護的情況，但是這種情況非常復雜，不知道是否適合在這里解釋。

APP計算機程序可獲得版權保護，也就是說，別人不能用跟你一樣的代碼作出相同或類似的APP。至于APP內的圖像、人物肖像等等，你可以擁有禁止他人使用相同或雷同的圖像、人物肖像等的權利。

專利保護的是技術方案，比如你的APP可以跟某一特定硬件設備（比如藍牙、鼠標、PC或MAC）通過一定方法，實現某種游戲效果，那么就只能你來用，別人不能使用這種方法。

以上請注意，商標專用權需要向商標局提出注冊申請，版權需要向中國版權保護中心申請計算機軟件著作權登記、作品登記，專利則需要向知識產權局(專利局)提出發明專利申請。

方法專利屬于發明專利，不可申請實用新型專利，實用新型專利僅僅保護產品結構。

版權的權利，自創作完成之日起，即已獲得，版權登記不是獲得權利的必備條件。但是，實踐當中，如欲以版權為依據主張權利，首先需要證明權屬，也就是說，你先要證明你是版權人，那么相關的創作底稿、源代碼、設計圖紙等等，都需要拿出來——如果不提前進行版權登記，可能發生的后果就是：
1. 起訴無門：實踐當中，版權訴訟案由情況下，法院基本上都會要求原告提供一份版權登記證書，作為推定權利人的憑證，如果你拿不出，但是侵權正在進行中，就非常尷尬了；
2. 底稿滅失無法舉證：這是版權訴訟原告敗訴的主要原因之一，如果多年以后發現被侵權，但是發現底稿都滅失了，即使事實上的真相你是權利人（作者），可是你無法在法庭上證明你自己，這也是非常尷尬的。
所以，版權登記是極有必要的——登記申請時，提交作品副本（如底稿、代碼頁）一份供存檔，發生糾紛時，可以向版權保護中心申請提供作品復印件給法院確證，這樣一來，可以免除非常繁重的舉證義務。盡管版權登記要花錢，但是相對于后期維權的成本而言，這點費用已經算是非常低了。

來自知乎-施榮Jonas